Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN8O00124 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms