Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
KNCNA6PVL3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
KNCNA6PVL3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms