Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00312Q9Y6C7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms