Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AFG3L2Q9Y4W6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms