Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SH3BP1Q9Y3L3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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SH3BP1Q9Y3L3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1Q9Y3L3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1Q9Y3L3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1Q9Y3L3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SH3BP1Q9Y3L3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SH3BP1Q9Y3L3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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