Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRXN1Q9ULB1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRXN1Q9ULB1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms