Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms