Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLAIN2Q9P270 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLAIN2Q9P270 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLAIN2Q9P270 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLAIN2Q9P270 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms