Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHMP5Q9NZZ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHMP5Q9NZZ3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms