Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATG3Q9NT62 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms