Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-5Q9HDB9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms