Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC52A2Q9HAB3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC52A2Q9HAB3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms