Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF17Q9BXT8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF17Q9BXT8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms