Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC106Q9BWC9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms