Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CICQ96RK0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CICQ96RK0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms