Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNFRSF13CQ96RJ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms