Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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