Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PGBD1Q96JS3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGBD1Q96JS3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms