Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAPGEF4Q8WZA2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms