Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LINC00301Q8NCQ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00301Q8NCQ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms