Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC155Q8N6L0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC155Q8N6L0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms