Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP31Q70CQ4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP31Q70CQ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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