Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf47Q6ZRZ4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms