Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms