Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD40Q6AI12 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms