Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SFT2D3Q587I9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SFT2D3Q587I9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms