Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GRIK5Q16478 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GRIK5Q16478 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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