Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms