Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAM2Q15035 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAM2Q15035 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms