Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME3Q13232 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME3Q13232 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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