Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LMAN2Q12907 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LMAN2Q12907 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms