Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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CNTN1Q12860 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNTN1Q12860 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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