Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TOP2BQ02880 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
TOP2BQ02880 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms