Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPEQ02224 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms