Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR1P84550 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SKOR1P84550 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms