Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIPPLY3P57055 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY3P57055 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms