Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP98P52948 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP98P52948 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP98P52948 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP98P52948 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NUP98P52948 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP98P52948 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms