Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCT8P50990 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCT8P50990 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCT8P50990 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCT8P50990 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms