Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRIM1P49642 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms