Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCGF2P35227 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms