Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFNP31947 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFNP31947 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SFNP31947 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFNP31947 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFNP31947 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SFNP31947 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms