Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SSFA2P28290 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSFA2P28290 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms