Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP5F1P24539 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP5F1P24539 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms