Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYT1P21579 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYT1P21579 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT1P21579 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT1P21579 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT1P21579 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYT1P21579 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYT1P21579 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms