Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD247P20963 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD247P20963 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD247P20963 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD247P20963 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD247P20963 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms