Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTLA4P16410 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTLA4P16410 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms