Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP2C9P11712 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP2C9P11712 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms