Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UQCRFS1P1P0C7P4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms