Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GJB1P08034 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB1P08034 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB1P08034 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GJB1P08034 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GJB1P08034 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB1P08034 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB1P08034 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB1P08034 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB1P08034 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB1P08034 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GJB1P08034 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms