Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APBA3O96018 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APBA3O96018 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APBA3O96018 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APBA3O96018 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APBA3O96018 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APBA3O96018 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APBA3O96018 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms